Nel giugno del 1989 l'Istituto per la pianificazione e la gestione di grandi progetti del Politecnico federale di Zurigo pubblica uno studio dettagliato sugli obiettivi e i modelli da considerare nell'organizzazione del progetto Alptransit. Per la sua realizzazione, i ricercatori elaborano il modello - poi applicato - del committente-costruttore-gestore, che distingue tra infrastruttura ed esercizio. La costruzione delle nuove trasversali alpine viene quindi affidata a due società giuridicamente indipendenti dalla BLS e dalle FFS, la AlpTransit Lötschberg SA e la AlpTransit San Gottardo SA. L'esercizio compete invece alle due società ferroviarie.
« Per agevolare al Parlamento e al Consiglio federale la gestione degli affari, le funzioni devono essere chiaramente distinte. »
Elektrowatt Ingenieurunternehmung AG, Zurigo,Organizzazione del progetto NFTA; obiettivi, modelli, valutazione, pag. 13-4, giugno 1989
